不同类型的活性污泥系统在去除微生物物质方面具有更高的功效，并且在去除污水污染的主要指标（包括大肠菌和粪大肠菌）方面要比其他提到的系统更有效。但是，某些研究报告称，活性污泥的不当操作，维护和不当处理也会降低其效率并减少微生物的去除。因此，建议进行有关如何改善活性污泥系统的操作，维护和适当管理的研究，以将知识转移给污泥系统的用户，并防止与微生物制剂有关的进一步健康问题。
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